ההיסטוריה וההווה, הזיכרון והשכחה בעניין פלאשוב מייצגים נקודת התייחסות לבניית עמדות אזרחיות פתוחות לעתיד. מוזיאוניאתרי ההנצחה הוקמו בשטחי המחנות לשעבר על מנת לשמר את הזיכרון בנוגע לפשעים שנעשו בשטחם באמצעות הגנה על המקומות שבהם הם התרחשו. הם קיימים כעדות ואזהרה ומטרתם היא לחנך ברוח ההומניטריות. יחד עם זאת, המקומות הללו קוראים לזכור את הקורבנות, בפרט את אלה שאף אחד אחר לא יכול לדאוג להם. חובת הזיכרון מוטלת על מוסדות הציבור, אך יחד עם זאת היא גם חובתו של כל אזרח.

המשימה של מוזיאון פלאשוב תיושם באמצעות:

- טיפול בשטח המחנה לשעבר;

- ניהול מחקרים בנוגע לעברו וקיום פעילויות חינוכיות;

- שהות באתר ההנצחה - עדות אמיתית להיסטוריה הנותנת הזדמנות להתבוננות מעמיקה יותר, לשינוי הרעיונות הקיימים על עצמנו ועל העולם, ובכך מאפשרת פיתוח אמפתיה ורגישות. ביקור באתר ההנצחה הוא צורה בסיסית של היכרות עם ההיסטוריה שלו והפגנת כבוד לקורבנותיו;

- קשר עם עדים ובני משפחותיהם, איסוף עדויות, מזכרות ושיתוף עדים בפעילויות המוזיאון, מה שמסייע בלימוד על ההיסטוריה של המקום ובבחינה של העבר.

המשימה של מוזיאון פלאשוב היא גם:

- מדע - איסוף ושימור של אוספים, ניהול מחקר היסטורי וארכיאולוגי, מתן גישה לארכיונים ולספרייה, ארגון תערוכות זמניות, כנסים והפצה של ידע;

- חינוך - פתוח ואמין, נגיש לכולם;

- השתתפות - בניית מערכות יחסים ויצירת פרויקטים משותפים (חינוכיים, מדעיים, אמנותיים) עם אנשים הדואגים לזכרו של פלאשוב;

- התנדבות.

מוזיאון פלאשוב שומר על זכרם של אלפי קורבנות מחנה פלאשוב הגרמני הנאצי לשעבר. בניית המוזיאון מוכתבת על ידי הצורך להנציח את ההיסטוריה הטרגית של מקום זה ולגבש את הידע על קיומו של המחנה וקורבנותיו. הקמת המוזיאון היא מענה לשנים רבות של פניות בנוגע להנצחת קורבנות פלאשוב. הזיכרון שלהם מטושטש ונשכח במהלך השנים. המוזיאון שואף להפוך את שטח מחנה פלאשוב לשעבר למקום של הרהור על ההיסטוריה וההווה.

תפקודו של מוזיאון פלאשוב אינו נפרד משימור האופי הטבעי, הירוק והפתוח של המקום הייחודי הזה. על שטח של כ-40 הקטאר, כולל 37 הקטאר של שטח המחנה לשעבר, ידאג המוזיאון הן לשרידי העבר והן לטבע ולצמחייה ירוקה במקום, תוך נקיטת הצעדים הנדרשים בלבד לשמירה על האופי האקולוגי של שטח זה. התכנון כולל רק כיסוח דשא ותחזוקה שוטפת של הצמחייה. התערבות ישירה בטבע בשטח המחנה לשעבר היא מינימלית ותישאר ככזו. צפויות רק פעולות טיפוח ובמצבי חירום.

שילוב הפונקציות המוזיאוניות וההיסטוריות של מוזיאון פלאשוב, תוך שמירה על האופי הירוק הקיים – זוהי יוזמה מוזיאונית ייחודית בקנה מידה בין- לאומי. היסטוריה, זיכרון, הרהור על העבר וההווה ודאגה לטבע - אלו ההנחות והמטרות העיקריות שנקבעו על ידי מוזיאון פלאשוב, מוסד תרבות של העיר קרקוב, במימון משותף של עיריית קרקוב והממשלה של רפובליקת פולין.

שמירה על האופי הפתוח והירוק של המקום והתערבות מינימלית בלבד בטבע בשטח המחנה לשעבר נובעים גם מסיבות משפטיות ודתיות. שטח המחנה לשעבר נרשם במרשם האנדרטאות וקיבל מעמד של בית קברות צבאי לפני יותר מ-10 שנים. יתרה מכך, ההלכה היהודית אינה מתירה התערבות בקרקע באזור בתי העלמין ואתרי קבורה של הקורבנות. מוזיאון פלאשוב יכבד את תקנות המדינה וגם את עקרונות הדת היהודית.